Ông Phùng Khánh Tài sinh năm 1971; dân tộc Kinh; quê quán ở xã Bát Tràng, huyện Gia Lâm, thành phố Hà Nội; Cử nhân Sư phạm kỹ thuật, Thạc sĩ Quản lý giáo dục; vào Đảng năm 1995…
Trước khi được hiệp thương giữ chức Phó Chủ tịch Uỷ ban Trung ương MTTQ Việt Nam, ông là Ủy viên Ủy ban Trung ương MTTQ Việt Nam, Chánh Văn phòng Cơ quan Ủy ban Trung ương MTTQ Việt Nam.
Ông Phùng Khánh Tài từng là giảng viên, Bí thư Đoàn trường Công nhân Cơ khí Nông nghiệp I; Thư ký Bí thư Tỉnh ủy tỉnh Quảng Trị; Ủy viên Đoàn Chủ tịch Ủy ban Trung ương Hội Liên hiệp Thanh niên Việt Nam; Ủy viên Ban Thư ký Trung ương Hội Sinh viên Việt Nam; Trưởng Ban Quốc tế Trung ương Đoàn Thanh niên Cộng sản Hồ Chí Minh; Phó Chủ tịch Hội Liên hiệp Thanh niên Việt Nam…/.