Theo quyết định, Chủ tịch Hội đồng là Bộ trưởng Bộ Y tế. Phó Chủ tịch Hội đồng là Thứ trưởng Bộ Y tế.
Các thành viên Hội đồng gồm đại diện các Bộ: Thông tin và Truyền thông; Kế hoạch và Đầu tư; Tài chính; Nội vụ; Tư pháp; Xây dựng; Giáo dục và Đào tạo; Lao động - Thương binh và Xã hội; Khoa học và Công nghệ; Văn hóa, Thể thao và Du lịch; Nông nghiệp và Phát triển nông thôn; Công Thương; Giao thông vận tải; Công an; Quốc phòng; Tài nguyên và Môi trường.
Ngoài ra, thành viên Hội đồng còn có các chuyên gia về quy hoạch. Chủ tịch Hội đồng xem xét, quyết định lựa chọn mời chuyên gia về quy hoạch tham gia Hội đồng.
Bộ Y tế phân công Cơ quan thường trực của Hội đồng.
Phương Nhi